建校于1962年，原名建联中学，由工商联合会与民主建国会合资建立。1965年曾改名“红卫中学”，1969年改为公办学校，正式更名“广州市第九十七中学”。

97中的办学理念是“为学生的健康人生奠基”，因此学校的学习氛围比较愉悦，初一初二的时候十分注重素养和能力的培养，进入初三后才会把精力放入升学备考上。很多人认为在这种办学模式下，学生的成绩会比较一般。其实不然，2004-2012年，97中连续9次获得海珠区初中毕业班工作综合评估一等奖；2005-2012年中考学科总平均分连续8年列海珠区公办学校第一名；2014年中考700分以上学生人数占全级35.7%，居海珠区公办学校第一；2016年，其中考成绩再创新高，海珠区中考总分状元就出自97中，700分以上人数占全校考生的42%，初三毕业生升读省一级以上学校占70%以上。可以说自从六中取消了初中公办后，97中成为了海珠区公办中学里面的佼佼者。

品牌强班是97中极力打造的特色，每一个班级都拥有自己的品牌特色，比如科技品牌班，国际生态班等。同时发挥“拇指爸妈家长学校”市级家长示范校的功能，加强家校联系，让家长和孩子共同成长。师资上，97中教师偏年轻化，充满活力。有近40位教师被评为省、市、区名教师，以及担任专委会、教研会会长等职位。97中的特级教师有57人，硕士、教育硕士50人。

97中十分注重学生能力与素养。通过举办艺术节、运动会、学科文化节，以及承办区环保科技节培养学生的综合素质。而作为广州市首批艺术重点基地学校，97中学生在科技、艺术、体育等各类竞赛中屡获殊荣，包括全国青少年无线电通讯大赛一、二、三等奖，国家、省、市级机器人大赛前三名等，击剑、排球、跆拳道等传统项目更在各级比赛中收获佳绩。

目前，97中拥有东晓南校本部、金碧花园校区和江南新苑校区等三个校区。其初中部在江南新苑校区，占地1.25万平方米，校园布局合理，教学设施先进；除配置校园网外，所有教室均配有多媒体电教平台及空调。另外，学校还拥有室内篮球馆、400人报告厅、700㎡舞蹈室、阳光书吧、创客工作室等各种活动场所，其饭堂更是中学里少有的食品卫生等级A级单位。